A Escola Básica e Secundária das Flores, ao longo dos tempos, apresentou diferentes estruturas físicas, consoante a exigência da sua densidade populacional. O pólo sede situa-se na vila de Santa Cruz, onde se leccionam todos os níveis de ensino, desde o pré-escolar, ao ensino secundário. No concelho de Santa Cruz, a freguesia Ponta Delgada oferece a educação pré-escolar e o primeiro ciclo. Relativamente ao concelho das Lajes, somente na vila das Lajes, existe uma escola, desde a educação pré-escolar ao segundo ciclo do ensino básico.
